Hierarki kepemimpinan Fakultas Agama Islam (FAI), Universitas Pesantren Tinggi Darul ‘Ulum Jombang (Unipdu), dapat dideskripsikan sebagai berikut :
- Universitas Pesantren Tinggi Darul ‘Ulum Jombang.
- Fakultas Agama Islam (FAI).
- Program Studi S-1 Pendidikan Agama Islam (PAI).
- Program Studi S-1 Hukum Keluarga (HK).
- Program Studi S-1 Pendidikan Guru Madrasah Ibtidaiyah (PGMI).
Susunan organisasi FAI Unipdu terdiri dari :
1. Pimpinan Fakultas
- Dekan.
- Wakil Dekan Bidang Akademik dan Kemahasiswaan.
- Wakil Dekan Bidang Keuangan, Sumberdaya Manusia dan Umum.
2. Pimpinan Program Studi
- Ketua Program Studi (Kaprodi).
- Sekretaris Program Studi (Sekprodi).
3. Pelaksana Akademik Fakultas dan Program Studi
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Praktik Pengalaman Lapangan (PPL) dan laboratorium microteaching.
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Pusat Komputer dan Internet.
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Perpustakaan.
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Pusat Studi Bahasa (PSB).
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Pusat Studi Qur’an (PSQ).
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Pusat Studi Wanita (PSW).
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Lembaga Penelitian, Pengembangan dan Pengabdian Masyarakat (LP3M).
- Unit Pelaksana Teknis (UPT) Lembaga Kewirausahaan yang terpusat di Universitas.
4. Unsur Pelaksana
- Kepala Bagian Tata Usaha.
- Sub Bagian Akademik dan Kemahasiswaan.
- Sub Bagian Keuangan.
- Sub Bagian Kepegawaian, Arsiparis dan Umum.
Struktur organisasi FAI Unipdu periode 2018-2022 adalah :
Dekan | : | Dr. Mujianto Solichin, M.Pd.I |
Wakil Dekan Bidang Akademik dan Kemahasiswaan | : | Nur Ulwiyah, M.Pd.I. |
Wakil Dekan Bidang Keuangan, SDM, dan Umum | : | Dr. H. Ali Muhsin, M.Pd.I. |
Ketua Prodi Studi PAI | : | Dr. Mohammad Syafi’i, M.Pd.I. |
Ketua Prodi Studi AS | : | Mahmud Huda, M.SI |
Ketua Prodi PGMI | : | Imam Mutaqin, M.Pd.I. |
Sekretaris Prodi PAI bidang Akademik | : | Lilik Maftuhatin, M.Pd.I. |
Sekretaris Prodi PAI bidang Kemahasiswaan | : | Dr. Dhikrul Hakim, M.Pd.I |
Sekretaris Prodi AS | : | Haris Hidayatulloh, M.HI |
Sekretaris Prodi PGMI | : | Galuh Tisna Widiana, M.Pd. |
Kepala Tata Usaha | : | Arifin, S.Ag, M.Pd.I. |
Sub.Bag. Keuangan | : | Lulus Oktavia Kartikasari, S.Pd. |
Sub Bag. Akademik dan Kemahasiswaan | : | Yulia Arofatus Sobah, S.Kom. |
Sub. Bag. Kepegawaian, Arsiparis dan Umum | : | Ahmad Mundir, S.HI. |
Ketua Unit Penjaminan Mutu, Penelitian dan Pengembangan Fakultas | : | Agus Mahfudin, M.Si |
Ketua Dewan Penyunting Jurnal Religi: Jurnal Studi Islam | : | H.M. Samsukadi, Lc. M.Th.I. |
Ketua Dewan Penyunting Jurnal Pendidikan Islam | : | Dr. Amrulloh, M.Pd.I. |
Ketua Dewan Penyunting Jurnal Hukum Keluarga Islam | : | Agus Mahfudin, M.Si. |
Ketua Dewan Penyunting Jurnal Pendidikan Dasar Islam | : | Indra Kusuma Wardani, M.Pd. |